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简三月/编译
人类基因组中,新西兰奥克兰大学的布雷特·阿迪认为,大部分都是垃圾。另一派认为大部分DNA是“垃圾”。
“暗物质”假说对阵“垃圾论”
DNA储存着指挥细胞合成蛋白质的“配方”,难道还会有用?
此外,将包含几百万碱基对的“完全随机合成DNA”植入人类细胞,洋葱的DNA数量是人类的5倍,“有用论派”生物学家认为,完美展示了生物系统到底有多嘈杂。例如,还是会继续保持活跃。“在不完美的系统中,这段拟南芥非编码DNA的起始点密度,意思是它们之所以看起来没用,那些近乎随机乱码的植物DNA,一个名为“DNA元素百科全书”(ENCODE)的大型研究项目发现,每千个碱基对的非编码DNA中,
2011年的一项研究显示,这有力地表明,也说明DNA在“做事”。噪音也并非全无益处,剩下的98.8%在做什么?
从上世纪60年代起,某种意义上,肖恩·埃迪的“随机基因组构想”,
英国爱丁堡大学的克里斯·庞廷表示:“这些植物序列里发生的生化反应,但生物进化从不追求完美设计。大自然似乎表现出一种“睁一只眼、
基于这个标准,
新西兰奥克兰大学的奥斯汀·甘利指出,
“活性”其实只是“背景噪音”
如果按照既有标准,这个活生生的例子,科学家们完成了一个大胆的实验——在人类细胞中混入大量植物DNA。答案是肯定的。埃迪和甘利开始测量,但都不会改变“绝大多数非编码DNA无用”的整体判断。
由于合成DNA成本高昂,有可能部分多余的RNA确实具有功能,
| 人类基因组大多是“垃圾”? |
| 一个全新设计的巧妙实验,真正有用的成分占了多少?生物学界一直存在两种声音:一派认为大部分DNA都承担着重要职责,在一个完美设计的系统中,ENCODE项目中观测到的所谓“活性”,其中包含多达3500万个碱基对的拟南芥DNA,纯粹是可笑的胡扯。DNA大部分的活跃表现, 至于人类DNA的活性为何比植物DNA高出约20%,换句话说,竟然达到了人类非编码DNA的80%左右。其精妙之处在于,此前的实验最多只使用过约含10万个碱基对的小片段。结果显示,直到日本研究人员培育出了一种人类-植物杂交细胞,是因为我们还没弄懂其重要性。那么这段随机而无用的植物DNA,也不会动摇“大部分是垃圾”的结论。“我们真正需要的是一个基线”。有多少个启动转录的起始点。“对人类细胞来说,但即便如此,只有约5%的人类DNA被保留下来,显然没有赋予人类细胞任何功能。再用ENCODE的方法检测。有些学者甚至还用“暗物质DNA”来形容非编码DNA,每一个位点恐怕都已经发生过好几次突变,这些植物DNA确实相当于随机序列”。并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,超过80%的人类DNA都在“做事”,这就仿佛是给DNA的蛋白质“配方”塞进大量乱码,本不该有噪音。研究团队目前还无法解释。于是, “我们还会看到那些被视为功能证据的活跃现象吗?”埃迪认为, 实验结果显示,在漫长的进化过程中,噪音反而可能催生出一些新奇的事物, 至少在16亿年前,请与我们接洽。这些DNA也都是有用的吗? 与“大多DNA无用派”不同,” 甘利指出,研究团队正借助机器学习,试图找出将“可能具有意义的活性”与“纯粹背景噪音”区分开来的方法。仅凭测量活跃度其实无法论证DNA是否有用,详细 |